固定費計画を策定したら、次は変動費計画の策定に着手します。 先述のように、経常利益と限界利益の関係は次のように表すことができます。

限界利益　＝　売上高　―　変動費
経常利益　＝　限界利益　―　固定費（支払利息含む）

限界利益が当期利益の源です。なので、固定費にはもう手を着けられず、競争が厳しく売上高の想定したものよりも下まわる場合、目標利益を確保するためには変動費率を引き下げることが必要になります。したがって、年度経営計画に変動費率を引き下げる計画を織り込むことが求められます。
主な変動費は、医薬品費、診療材料費、医療消耗品費、検査委託費ですので、ここにメスを入れなければなりません。
実務的には、費用の性質に合ったコストダウン計画を立てます。