確定申告書を提出する個人が、平成16年1月1日から平成21年12月31日までの間に譲渡の年の1月1日における所有期間が5年を超える居住用財産(譲渡資産)の譲渡(その個人の親族等に対する譲渡や贈与又は出資による譲渡を除きます。以下「特定譲渡」といいます。)をした場合において、その個人が特定譲渡に係る契約を締結した日の前日において譲渡資産に係る住宅借入金等（注1）の金額を有しており、かつ、その特定譲渡による譲渡所得の金額の計算上生じた損失の金額がある場合には、その損失の金額のうち一定の金額(以下「特定居住用財産の譲渡損失の金額（注2）」といいます。)について、他の所得と損益通算する特例及び翌年以後3年内の各年分の総所得金額等の金額の計算上一定の方法により繰越控除する特例の適用を受けることができます。

（図：「特定居住用財産の譲渡損失の金額」の例）
これらの損益通算及び繰越控除の特例は、新たな居住用財産（買換資産）の新築又は購入が要件とされていませんので、買換資産を取得するしないにかかわらず適用することができます。
なお、次のいずれかに当てはまる場合には、これらの特例の適用を受けることはできません。

１． 損益通算の特例を受けて損益通算しようとする年の前年以前3年以内の年において生じた他の特定居住用財産の譲渡損失の金額について、損益通算の特例の適用を受けている場合
２． 譲渡資産の特定譲渡をした年の前年又は前々年において行った資産の譲渡について次の特例の適用を受けている場合
（1） 居住用財産を譲渡した場合の長期譲渡所得の課税の特例(措法31の3)
（2） 居住用財産の譲渡所得の3,000万円の特別控除(措法35)
（3） 特定の居住用財産の買換えの場合の長期譲渡所得の課税の特例(措法36の2)
（4） 特定の居住用財産を交換した場合の長期譲渡所得の課税の特例(措法36の5)
（5） 相続等により取得した居住用財産の買換えの場合の長期譲渡所得の課税の特例(旧措法36の2)
（6） 相続等により取得した居住用財産の交換した場合の長期譲渡所得の課税の特例(旧措法36の5)
３． 譲渡資産の特定譲渡をした年又はその年の前年以前3年内における資産の譲渡について、居住用財産の買換え等の場合の譲渡損失の損益通算の特例(措法41の5第1項)の適用を受ける場合又は受けている場合また、特定居住用財産の譲渡損失の金額が生じた年の翌年以降3年以内の各年分のうち、合計所得金額が3,000万円を超える年分については、繰越控除の特例の適用を受けることはできません（損益通算の特例については所得制限はありません。）。

特定居住用財産の譲渡損失の損益通算及び繰越控除の特例は、住宅借入金等特別控除制度との併用が認められています。